アメリエフのブログ

バイオインフォマティクスの紹介と社員の日々
【お詫び】お問い合わせページの不具合を修正しました
弊社HP上の「お問い合わせ」ページがエラーとなり、現時刻までの約1週間ほど、動作しない状態でした。。
ご迷惑をおかけしました。申し訳ございません。

現在は復旧しておりますので、勉強会の参加表明やお問い合わせにご利用いただけましたら幸いです。

今後とも、よろしくお願い申し上げます。

山口
| 社長 | 会社のこと | 00:12 | comments(0) | trackbacks(0) |
【勉強会のお知らせ】ゲノムマップViewerの使い方
アメリエフ株式会社の山口です。

10月2日(土)に開かれる第三回バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

今回のテーマは、「ゲノムマップのviewer」です。
「UCSC GenomeBrowser」と「IGV(Integrative Genomics Viewer)」を利用し、
次世代シーケンサーによる解析結果をゲノムマップ上で閲覧する方法や、
CNV解析、メチル化解析などの結果をゲノムマップ上で表示する方法をご紹介いたします。

・UCSC GenomeBrowser
http://genome.ucsc.edu/

・IGV(Integrative Genomics Viewer)
http://www.broadinstitute.org/igv/


              記
日時: 2010年10月2日(土) 15時〜17時
場所:文京区シビックセンター5階 区民会議室D
地図:文京シビックセンター・案内図
定員:20名
予算:お一人500円

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
基本的にはWindows上での操作になります。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。


また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
予算は4000円〜5000円です。


勉強会のみの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
9/27(月)までにこちらのお問い合わせフォームまでご連絡をお願いいたします。

勉強会(15時〜17時)   ○
懇親会(17時半〜)    ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。


ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡いただけましたら幸いです。

よろしくお願い申し上げます。
| 社長 | 勉強会 | 17:53 | comments(0) | trackbacks(0) |
「QuickGWAS」についてのご質問&回答
アメリエフ社長の山口です。

2010年9月1日にSNPデータ解析ソフト「QuickGWAS」をリリースさせていただきました。

SNPチップやシーケンサーなどから得られるSNPタイピング結果に対して、ケース・コントロール解析やQTL解析等の遺伝統計解析を行うことは容易ではありませんでしたが、「QuickGWAS」の登場によってSNPチップによるジェノタイピング結果については、Web上で簡単にデータ解析ができるようになったと自負しております。


ここで、この数日間にいただいたご質問にお答えしたいとおもいます。

Q.クラウド上での運用は、セキュリティやサーバーの場所等で心配なんだけど・・・。
A.結論から言いますと、IIJ社が運用する「IIJ GIO」というクラウドサービスを利用しているため安心です。

【参照】
IIJ(株式会社インターネットイニシアティブ)


「IIJ GIO」のご担当者様によると、サーバー自体は関西圏にあるそうです。「QuickGWAS」のお客様の大半は研究機関と想定しているのですが、IIJは歴史的に学術機関が所属するインターネット基幹網に太いパイプを持っています。

弊社自身のプロバイダーはNiftyですので、当初は通信上近いNiftyクラウドも検討したのですが、大容量のファイルを扱うためお客様からの通信環境(通信上の近さ)は妥協できないことと、サーバー運用業界の老舗であるIIJのノウハウや信頼感を重視しての決断でした。


Q.セキュリティポリシーがあるため、インターネット上にデータをアップロードすることができないのですが・・・。
A.所属機関のセキュリティポリシーで、データを一切外部に出せない研究室様のために、研究室内でクローズドな環境で動作する「QuickGWAS Offline版」もご用意しています。


Q.「QuickGWAS」で提供される解析に加えて、QTL解析やハプロタイプ解析、LD解析をしたいのですが・・・。
A.今後のバージョンアップでQTL解析やハプロタイプ解析の機能を追加予定ですが、お急ぎの場合やより深い解析をご検討の際は、弊社のSNPデータ解析受託サービスをご利用ください。


Q.年間契約ですが、利用回数の制限はあるのでしょうか。
A.同時に登録できるケース・コントロール群は3セットまでですが、ご利用回数の制限はありませんので、古い解析結果をサーバー上から削除した上で、何度でもご利用いただけます。


ご参考になりましたでしょうか。
「QuickGWAS」についてのお問い合わせはこちらになります。
| 社長 | 会社のこと | 23:40 | comments(0) | trackbacks(0) |
「QuickGWAS Online」をリリースしました!
お久しぶりです!
キムです。

今日はお知らせがあります。
ゲノムワイド関連解析ソフト「QuickGWAS Online」を
9月1日(本日)リリースしました!


設立から今日まで、アメリエフは多くのお客様や周りの方々に支えられながら、たくさんの経験を積んでまいりました。
「QuickGWAS Online」は、DNAチップから得たデータの主要なゲノムワイド関連解析を3つのステップで簡単に行える統計解析ソフトです。
サービスはクラウド上に構築し、SaaS型(インターネットを介してサービスを提供する形態)で提供しています。

これまでのゲノムワイド関連解析の受託のお仕事を通して、蓄積されたノウハウが、ぎゅっと詰まっています。

今後も、新機能やラインナップも充実させていきますので、どうぞよろしくお願いいたします。

製品ページはこちらです。
ニュースリリースはこちらです。
| きむ | 会社のこと | 18:02 | comments(0) | trackbacks(0) |
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