アメリエフのブログ

バイオインフォマティクスの紹介と社員の日々
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すら(SRA)っとクイック(Q)に変換
NCBI SRAからダウンロードしたファイルがsraフォーマットの場合、以下のコマンドでまとめてfastqに変換すると便利です。

$ find . -name '*.sra' -exec fastq-dump {} ¥;


fastq-dumpについては
NCBI SRA Toolkitの使い方
も、findコマンドについては
findの-execオプション
もご覧ください。

| hat | バイオインフォマティクス | 15:08 | comments(0) | - |









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