アメリエフのブログ

バイオインフォマティクスの紹介と社員の日々
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vcfファイル
samtoolsは、次世代シーケンサデータ解析において、多型を抽出するツールとして広く使用されています。

このsamtoolsで抽出された多型情報は、“vcfファイル”のファイル形式で算出されます。

WETな先生方からよくお聞きする声の中に、

「このvcfファイルの中身がわかりずらい」

という意見がよくあります。

下図がvcfファイルの中身です


多くの情報が入っているため、一見ごちゃごちゃしているように見えますね。

ですので今週は、vcfファイルの中身について記載していこうかと思っています。
| | 次世代シーケンサー解析 | 19:26 | comments(0) | trackbacks(0) |









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