アメリエフのブログ

バイオインフォマティクスの紹介と社員の日々
BEDTools 1
今日は、BEDToolsを簡単にご紹介いたします。
URL:http://code.google.com/p/bedtools/
BEDToolsは、NGSのデータ解析で役に立つツールです。

まず、bamToBedを使って、BAMファイルをBEDファイルに変換する作業をしてみましょう。
igvで表示すると下記のようになります。
SRX033211.sorted.bedという灰色で表示されているファイルが、
作成したBEDファイルです。

折をみて、詳しい説明をしていきたいと思います。
| きむ | 次世代シーケンサー解析 | 14:57 | comments(0) | trackbacks(0) |
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