アメリエフのブログ

バイオインフォマティクスの紹介と社員の日々
NGSハンズオン講習会
7月22日(水) から次世代シーケンサ(NGS)ハンズオン講習会が開催されています。

本講習会は、バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)の主催で、NGS解析を学びたい方を対象に行われており、弊社からは講師として2名、TAとして2名が参加しています。
今週までに、スクリプト言語として以下の講義を担当しました。
7/24(金) シェルスクリプト
7/27(月) Perl入門
7/28(火) Python入門

今週はNGS解析の講義が行われています。
8/3(月) NGS解析基礎
8/4(火) Reseq、変異解析
8/5(水) RNA-seq
NGSハンズオン
NGS解析については、8/26〜8/28に2回目の講義が行われます。

弊社では受託解析だけでなくバイオインフォマティクス勉強会や出張トレーニングも行っておりますので、今回のハンズオン講習会に参加できなかった方や参加されている方でもっと勉強したいという方は、ぜひご利用ください。
| onouek | スクール | 14:42 | comments(0) | - |
バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム 速習コース
バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム(次世代シークエンサ)速習コース にて一部の講義を担当させていただきました。

シェルスクリプト・Perl
・日時:2014年9/3(水)・9/4(木)
・講師:服部

次世代シークエンサ実習
・日時:2014年9/10(水)・9/12(金)
・講師:山口

講義の資料などは、オーガナイザーの門田先生のページでご覧いただけます。

弊社の通常のトレーニングは少人数なので受講生の様子を見ながらペースや難易度を調節できるのですが、今回は大人数(70名〜)ということで、初心者の方に合わせることに決めて、やさしめ・ゆっくりめの内容とさせていただきました。
既にご自身で勉強されている方には物足りないのではないかと心配していましたが、「改めて網羅的に学べて良かった」というご意見もいただけたので、ひとまずほっとしています。

VirtualBoxの設定や、難しい質問が出た時などにはTAや受講生の方々がすぐ調べて代わりに答えてくださったので、非常に助かりました(笑)。私もとても勉強になりました。

ありがとうございました。
| hat | スクール | 15:56 | comments(0) | - |
徳島大学でPerlを講義させていただきました
2014年8/6(水)〜7(木)、徳島大学 蔵本キャンパス図書館にて、「Perl入門」を講義させていただきました。

実習では「ここはこうしたらいいんじゃないか」と活発なアイデアが飛び交い、早速Perlを使いこなしていただいているのが嬉しく、講師冥利につきる想いでした。
ご受講いただいた皆様、ありがとうございました。

阿波踊りの前の週だったため、ほうぼうから三味線の音が聞こえ、祭りの前のわくわくした雰囲気が伝わってきました。
夜は、徳島のおいしい地酒と新鮮なお魚や鶏を堪能し、徳島が大好きになりました。

今度はぜひプライベートで阿波踊りを見に行きたいです。
| hat | スクール | 16:59 | comments(0) | - |
全国ツアー2014夏
hatです。

8月第二週は、日本各地のお客様から出張トレーニングのご注文をいただきまして、5日間連続でPerlやLinuxの講師をさせていただくことになりました。

昔から、自分は人にものを教える仕事は絶対向いていないと思い、教員免許をとることなど考えたこともなく、コンピュータと二人の世界を築きたくてSEになったはずだったのですが、気づくとお客様に何かを教える機会が増えていて、人生は不思議なものだと思います。

話し下手で、何を言いたいのかよくわからないと言われる私ですが、私なりに「ITは便利なんですよ!」「こっち(IT)も楽しいですよ!」という思いで一生懸命ご説明させていただいております。

「hatさん、説明は下手だし例えも意味がよくわからなかったけど、なんかLinux(Perl、R、...)っておもしろそうだな、ちょっとやってみようかな」と感じていただけたら嬉しいなあと思います。
| hat | スクール | 12:48 | comments(0) | - |
2014年夏 バイオインフォマティクススクール開催のお知らせ
バイオインフォマティクス・スクールのご案内です。
現在、下記の講座のお申込みを受付けております。
これからLinuxを用いたNGSデータ解析を行う方バイオ研究にプログラミング言語「Perl」を使いたい方統計解析パッケージ「R」を使った統計解析を短期間で学習したい方におすすめのコースとなります。

■Linux基礎
神戸会場
6月開講:6月19日(木)〜20日(金)

■Perl基礎
神戸会場
7月開講:7月3日(木)〜4日(金)

■R基礎
神戸会場
7月開講:7月10日(木)〜11日(金)

詳細は弊社ホームページをご覧ください。
| akb | スクール | 15:20 | comments(0) | - |
スクールの楽しみ
hatです。

2月、3月はバイオインフォマティクス・スクールが続きます。

2/6-7「Linux基礎」、2/13-14「Perl基礎」は
弊社が加入している健康保険組合の市ヶ谷の会議室をお借りして
行うことになりました。

お申込みいただいた方には地図をお送りしておりますが、
最寄駅は、新宿線「曙橋駅」、大江戸線「牛込柳町駅」または
丸ノ内線「四谷三丁目駅」になります。

私のスクールの楽しみの一つが、参加していただいたみなさんと
一緒にお昼を食べることなのですが、今回は、同じビルに
リストランテ アル・ファーロという、格安でおいしいイタリアンが
ありますので、こちらにお誘いしようかなあと考えています。

組合員同伴でないと入れないお店ですので、この機会にぜひ。
| hat | スクール | 13:29 | comments(0) | - |
2013年後半 バイオインフォマティクス・スクール開講のご案内
バイオインフォマティクス・スクールのご案内です。
現在、下記の講座のお申込みを受付けております。
これからLinuxを用いたデータ解析統計解析パッケージ「R」を短期間で学習したい方におすすめのコースとなります。

■Linux基礎
浜松町会場
10月開講:10月10日(木)〜11日(金)申込締め切り:9月19日(木)
神戸会場
11月開講:11月14日(木)〜15日(金)申込締め切り:10月24日(木)

■R基礎
浜松町会場
10月開講:10月17日(木)〜18日(金)申込締め切り:9月26日(木)
神戸会場
11月開講:11月28日(木)〜29日(金)申込締め切り:11月7日(木)

詳細は弊社ホームページをご覧ください。

また今秋にはプログラミング言語「Perl」の基礎講座の開講を予定しております。併せてご検討ください。
| akb | スクール | 15:08 | comments(0) | - |
バイオインフォマティシャン養成プログラム開講のお知らせ
ライフサイエンスを学ぶ学生(学部生・修士課程)の方を対象に、バイオインフォマティシャン養成プログラムを開催いたします。
必修科目では、バイオインフォマティクスの基本となるLinux操作や、プログラミング言語perlを用いた簡単なプログラミングを学びます。
さらに選択科目を通して、より実践的な解析手法を学ぶことができます。
みなさまの研究を効率よく行うためのスキルアップをサポートいたします。

■カリキュラム
・8月1日、2日、3日、8日、9日、10日の計6日間で開講します
・1日に1コマ90分の講義を2〜3コマ行います
・解析の基本から実践的な内容までトレーニングを行います

■科目・価格一覧


■お申込み方法
参加をご希望の方は、弊社ホームページのお問い合わせより、次の項目をご記入の上、お申し込みください。
(1) お名前(よみがな)
(2) 現住所
(3) 連絡先 
(4) 学校名、学部名、専攻名など

詳細は弊社ホームページでもご覧いただけます。
| akb | スクール | 15:12 | comments(0) | - |
神戸開講・バイオインフォマティクス・スクール追加募集行います
6/20(木)・21(金)、浜松町会場にてバイオインフォマティクス・スクール「R基礎バイオ統計」を開講しました。
統計解析パッケージ「R」を用いて初めて解析を行う方を対象に、Rを使うメリット、基本コマンドからマイクロアレイ解析など実践的な解析手法までを実習を交えてご紹介しました。

次回の開講は、7月18〜19日(神戸会場)です。
また、「Linux基礎」もお申込み受付中ですので、ぜひご検討ください。
追加募集を行う期間については、下記のとおりです。

追加募集を行う期間
Linux基礎:2013年6月21日(金)〜 7月5日(金)
R基礎バイオ統計:2013年6月27日(金)〜 7月12日(金)


受講前にソフトウェアの準備がございますので、ご検討中のみなさまはお早めにお申し込みください。

カリキュラムとお申込み方法はこちらからご確認いただけます。
リクエストやご質問などございましたら、お気軽にお問い合わせフォームよりご相談ください。
| akb | スクール | 18:44 | comments(0) | - |
「Linux基礎」6月期終了
6/6(木)・7(金)、浜松町会場にてバイオインフォマティクス・スクール
「Linux基礎」を開講しました。

Linux初心者の方を対象に、Linuxを使うメリット、基本コマンド、
ソフトウェアのインストールなどを実習を交えて学んでいただきました。

受講生の方たちからは、絶妙なタイミングで、的をついた
良い質問がたくさん出ました。

初めて端末からコマンドを入力する際、コマンドの後ろに
空白を入れ忘れる方が多いので、気を付けていただくために

ここで はきものをぬいでください
 と
ここでは きものをぬいでください
 では意味が変わりますよね!空白は大事なんですよ!

という小ネタを入れようと思っていたのですが、言おうとした矢先に
「コマンドの後の空白は入れないといけないのですか」
とご質問があり、そこでうっかり真面目に詳しく解答してしまったため、
秘蔵のこのネタはご披露できませんでした。
今後ぜひリベンジしたいと思います。

ちなみに「'Hi Jack!'と'Hijack!'は違いますよね?」という英語バージョンもあります。

バイオインフォマティクス・スクールの今後の開講スケジュールです。

・Linux基礎
【神戸会場】7月11日(木)〜12日(金)

・R基礎バイオ統計
【浜松町会場】6月20日(木)〜21日(金)
【神戸会場】7月18日(木)〜19日(金)

詳細は弊社HPをご覧ください。
| hat | スクール | 15:36 | comments(0) | - |
6月期「Linux基礎」「R基礎バイオ統計」開講のご案内
この度は Linux基礎(6月6日〜7日)、R基礎バイオ統計(6月20日〜21日)に多数のお申込みをいただきありがとうございます。
上記の講習につきまして、開講が決定致しましたことをお知らせいたします。
お申込みいただいた皆様へ、順次シラバスを発送いたしますので今しばらくお待ちくださいますようお願い致します。

また、引き続きお申し込みを受け付けております。追加募集を行う期間については、下記のとおりです。

追加募集を行う期間
Linux基礎:2013年5月17日(金)〜 5月31日(金)
R基礎バイオ統計:2013年5月31日(金)〜 6月14日(金)


受講前にソフトウェアの準備がございますので、ご検討中のみなさまはお早めにお申し込みください。

カリキュラムとお申込み方法はこちらからご確認いただけます。
リクエストやご質問などございましたら、お気軽にお問い合わせフォームよりご相談ください。
| akb | スクール | 17:04 | comments(0) | - |
バイオインフォマティクス・スクールのご案内
バイオインフォマティクス・スクールのご案内です。
現在、下記の講座のお申込みを受付けております。
短期間で学習したい方におすすめのコースとなります。

■Linux基礎
浜松町会場
6月開講:6月6日(木)〜7日(金) 申込締め切り:5月16日(木)
神戸会場
7月開講:7月11日(木)〜12日(金)  申込締め切り:6月20日(木)

■R基礎バイオ統計
浜松町会場
6月開講:6月20日(木)〜21日(金)  申込締め切り:5月30日(木)
神戸会場
7月開講:7月18日(木)〜19日(金)  申込締め切り:6月27日(木)

詳細は弊社ホームページをご覧ください。

どうぞよろしくお願い申し上げます。
| akb | スクール | 11:42 | comments(0) | - |
Linux基礎 短期コース in 神戸 3月期 お申込み受付中です
バイオインフォマティクス・スクール『Linux基礎 短期コース in 神戸』のご案内です。現在、3月期のお申込みを受付けております。
Linuxを扱った経験がない方や初級者の方、また集中して学習したい方におすすめのコースとなります。

■Linux基礎 短期コース
2時間×5回の講義を2日間で学ぶコースです。

■開催日 : 3月12日(火)第1回 10:00〜12:00
               第2回 13:30〜15:30
               第3回 15:45〜17:45
       3月13日(水)第4回 10:00〜12:00
               第5回 13:30〜15:30

■会場   : 神戸会場

■講義内容:第1回 Linuxとは
      第2回 Linux のコマンドを用いたファイルの加工方法
      第3回 ソフトウェアのダウンロード方法と使用方法
      第4回 次世代シーケンスの公開データおよび解析ツールの活用
      第5回 次世代シーケンスのデータ解析

詳細は弊社ホームページでもご覧いただけます。
お申込みはこちらからお願いいたします。

関東圏の方は、『Linux基礎 定期コース in 東京』、『Linux基礎 短期コース in 東京』も開講しておりますので、こちらをご検討いただけましたら幸いです。

どうぞよろしくお願い申し上げます。
| akb | スクール | 10:36 | comments(0) | trackbacks(0) |
『バイオインフォマティシャン養成プログラム』開催のお知らせ
ライフサイエンスを学ぶ学生の方を対象に、バイオインフォマティシャン養成プログラムを開催いたします。
必修科目では、バイオインフォマティクスの基本となるLinux操作や、プログラミング言語perlを用いた簡単なプログラミングを学びます。
さらに選択科目を通して、より実践的な解析手法を学ぶことができます。
みなさまの研究を効率よく行うためのスキルアップをサポートいたします。

■開講時間
月に1度、1コマ90分の講義を2コマ行います。

■科目・価格一覧


■お申込み方法
参加をご希望の方は、弊社ホームページのお問い合わせより、次の項目をご記入の上、お申し込みください。
(1) お名前(よみがな)
(2) 現住所
(3) 連絡先 
(4) 学校名、学部名、専攻名など

詳細は弊社ホームページでもご覧いただけます。

ご検討よろしくお願い申し上げます。
| akb | スクール | 09:40 | comments(0) | trackbacks(0) |
スクールDay6
akbです。

明日は、バイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」の最終回です。

第五回では第四回の解析結果を考察し、Fastx-toolkitを用いてトリミングを行っていただきました。
講義の後半では「解析の自動化」を行うためのシェルスクリプトの実行方法を学びました。
次世代シーケンスデータの解析は、複数の解析ツールを組み合わせて行います。これまでの講義で解析結果の集計や解釈、また必要に応じた解析ツールの使用方法を習得していただけましたら幸いです。

今回は、プログラミング言語perlを学びます。
前回の講義で作成していただいたVCFファイルを任意に定めた基準でフィルタリングを行うプログラムを作成していただきます。
プログラミングを習得することで、様々なファイルの加工が可能になります。

それでは最終回も頑張っていきましょう。
浜松町でお待ちしております。
| akb | スクール | 09:18 | comments(0) | trackbacks(0) |
スクールDay5
akbです。

今週土曜日はバイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」の第五回です。スクール10月期も残すところ2回となりました。

前回はFastQC、BWA、SAMtoolsなどのツールを用いた次世代シーケンスデータの解析を行いました。
結果をFastqcのレポートファイルやIGVによる可視化から考察していただきました。
今回は、前回の解析結果の考察を考慮して解析を進めていきます。
「解析結果の違い」に着目していただけると幸いです。
講義の後半では「解析の自動化」を行うためのシェルスクリプトが登場します。
内容が盛り沢山の第五回ですが、少しでも理解を深める事が出来ますよう努めてまいります。
それでは浜松町でお待ちしております。
| akb | スクール | 12:45 | comments(0) | trackbacks(0) |
スクールDay4
tokunagaです。

前回スクールDay3の演習では実際に2つのツールをインストールして動かしていただきました。
PATHの概念やシンボリックリンクなど、最初はなかなか理解しづらい箇所がありましたが、実戦を通しておわかりいただけましたでしょうか?
前回のツールのインストール手順を理解していただければ、おそらく大体のツールに対応することが出来るのではないかと思います。

Day4からは、次世代シーケンサーデータのテストデータを用いて解析の流れに沿って様々なツールを使用していきます。コマンドラインでツールを実行する時のポイントを押さえていただきたいと思っております。
今週土曜日もよろしくお願いいたします。
浜松町までお気を付けてお越しくださいませ。

また、次回のバイオインフォマティクス勉強会の第一部では「はじめてのLinux〜コンパウンドヘテロを探してみよう〜」というテーマで便利なLinuxコマンドの簡単なご紹介などをさせていただく予定です。

Linuxとはどのようなものか、どのようなことが出来るのか知りたいという方、またはLinux基礎を受けてみたいけど迷われている方などいらっしゃいましたら、次回勉強会にお越しいただけると幸いです。

皆様にお会いできますことを楽しみにしております。
| tokunaga | スクール | 09:02 | comments(0) | trackbacks(0) |
Linux基礎 短期コース in 神戸 開講のご案内
このたび弊社では大変ご要望が多かった『Linux基礎 短期コース』
3月期を神戸会場にて開講いたします。

座学と実践を組み合わせた実習形式で、次世代シーケンスデータの解析方法を
基礎から学ぶことができる内容となっております。
ご検討いただけましたら幸いです。

■Linux基礎 短期コース
2時間×5回の講義を2日間で学ぶコースです。
■開催日 : 3月12日 10:00〜12:00、13:30〜15:30、15:45〜17:45
       3月13日 10:00〜12:00、13:30〜15:30
■会場   : 神戸会場

詳細は、こちらからお問い合わせください。

よろしくお願い申し上げます。
| akb | スクール | 14:18 | comments(0) | trackbacks(0) |
<新規開講>「Linux基礎」短期コース
「短期間で修了したい」「平日に開催してほしい」
というご要望にお応えしました。

☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆
 バイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」に
 短期コースを開講します!
☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆

■開催日: 2013年2月7・8日(2日間)
■会場 : 浜松町会場

これまで日程がネックで参加が難しかったみなさまも
ぜひご検討ください。

通常の、土曜日午後に開催するコースも2月期から開講します。
こちらは全5回です。

詳細はスクールのページをご覧ください。

★お知らせ★
分子生物学会会場にて会社説明会を開催する予定です。
日程や場所など詳細が決まりましたら
ブログとホームページでご案内させていただきます。
| hat | スクール | 16:56 | comments(0) | trackbacks(0) |
Linux基礎7月期終了&10月期スタート
tokunagaです。

先日Linux基礎の7月期が終了いたしました。
参加者の皆様、この3ヵ月間お疲れ様でした。講義終了後のお茶会でご意見、ご感想をお聞かせいただきありがとうございました。
今まで全くわからなかったけれど講義を通してNGS解析の流れが理解出来たというお声もいただき、我々が少しでもお役に立てたこと非常に嬉しく思います。これからも研究支援のため精進してまいりますので何卒よろしくお願いいたします。

そして、今週末からLinux基礎の10月期がスタートいたします。
受講者の方、Linux基礎にお申込みいただきまして誠にありがとうございます。実践形式の講義ですが、わからない箇所がありましたら教室に控えている弊社スタッフがしっかりサポートさせていただきますのでご安心ください。
これから3か月間よろしくお願いいたします。
それでは土曜日、浜松町にてお待ちしております。
| tokunaga | スクール | 09:52 | comments(0) | trackbacks(0) |
スクール「Linux基礎」2012年10月期の募集を開始しました
バイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」2012年10月期の募集を開始しました。
「Linuxやプログラミングを始めたいけど、最初の一歩がなかなか踏み出せない」という方にお勧めプログラムです。

第1回 10月06日(土)13:30〜15:30
  Linuxとは

第2回 10月13日(土)13:30〜15:30
  Linux のコマンドを用いたファイルの加工方法

第3回 11月17日(土)13:30〜15:30
  ソフトウェアのダウンロード方法と使用方法

第4回 12月01日(土)13:30〜15:30
  次世代シーケンスの公開データおよび解析ツールの活用

第5回 12月08日(土)13:30〜15:30
  次世代シーケンスのデータ解析

第6回 12月22日(土)13:30〜15:30
  自作のプログラムによるファイルの加工方法

詳細はこちらの資料をご覧ください。
| きむ | スクール | 14:34 | comments(0) | trackbacks(0) |
Linux基礎・第五回
akbです。

明日はバイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」の第五回です。

前回はFastQC、BWA、SAMtoolsなどのツールを用いた次世代シーケンスデータの解析を行いました。
第五回のテーマは前回に引き続き次世代シーケンスデータの解析です。
今回は、前回の解析結果を生物学的に考察しながら解析を進めていきます。
「解析結果の違い」に着目していただけると幸いです。
講義の後半では「解析の自動化」を行うためのシェルスクリプトが登場します。

内容が盛り沢山の第五回ですが、少しでも理解を深める事が出来ますよう努めてまいります。

それでは明日、浜松町でお待ちしております。
| akb | スクール | 14:42 | comments(0) | trackbacks(0) |
Linux基礎・第四回
akbです。

明日はバイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」の第四回です。

前回はソフトウェア(BLASTとBWA)のダウンロード方法と使用方法についてご説明しました。

いよいよ今回から次世代シーケンスデータの解析が始まります。
次世代シーケンスデータの解析を行うための様々な公開ツールが登場します。
楽しみながら解析手順を身に付けていただけましたら幸いです。

それでは明日、浜松町でお待ちしております。
| akb | スクール | 17:08 | comments(0) | trackbacks(0) |
明日はLinux基礎・第二回
暑い日が続きますね。hatです。

明日はバイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」の第二回です。

前回はLinuxの基本概念(CUIでの作業、ディレクトリ構造、アクセス権限など)についてご説明しました。

復習として、受講生の方に「作業ディレクトリのJapanディレクトリ内に好きな県/市のディレクトリを作成する」という課題を実施していただいたのですが、いろいろな地名が出てきて楽しませていただきました。

今回はコマンドを使ってテキストデータを操作する方法についてご説明します。
「世界の高い建物100」というテストデータをご用意しました。楽しみながら実習していただけるといいなと思います。

それでは暑い中申し訳ありませんが、浜松町でお待ちしております!
| hat | スクール | 16:45 | comments(0) | trackbacks(0) |
Linux基礎7月期スタート
tokunagaです。
明日はいよいよバイオインフォマティクス・スクールの7月期がスタートいたします。

お申込みいただきました受講者の方々へこの場を借りて深く御礼を申し上げます。
この講義を通しまして、実際の解析で「つかえる技術」を身につけていただけますよう努めてまいりますので、この3か月間どうぞよろしくお願いいたします。

それでは明日、会場までお気をつけてお越しくださいませ。
| tokunaga | スクール | 11:16 | comments(0) | trackbacks(0) |
4月期終了
tokunagaです。

バイオインフォマティクススクールの4月期が先週土曜日に終了いたしました。

参加者の皆様、4月からの3か月間(計6回)お疲れ様でした。
最初はLinux操作の基礎の基礎から、最終日には実際の解析で使用出来るツールを使った応用まで幅広く行ってきましたが、いかがでしたでしょうか?
この期間にLinuxを用いた解析について、少しでも理解を深めるお役に立てていましたら幸いです。

今後とも皆様からいただいたご意見を素に、より良い内容へと改善していきたいと思っております。

さて7月期も締切日が迫っておりますがまだまだ募集中です。ご興味のある方はお気軽にお問合せください。
| tokunaga | スクール | 12:57 | comments(0) | trackbacks(0) |
スクールのCMができました
以前アナウンスしたバイオインフォマティクス・スクールのCMが完成しました。



弊社スクールの雰囲気が伝われば幸いです。
7月開講の「Linux基礎(全6回)」が現在お申込み受付中です。
お申し込みはお早めに!
| hat | スクール | 15:11 | comments(0) | trackbacks(0) |
アメリエフCM・2012夏
弊社バイオインフォマティクス・スクールの雰囲気をたくさんの方にお伝えしたく、イメージビデオを撮影しました。

監督・撮影・編集は不肖hatが担当させていただきました。
講師である社長の山口が「Linuxの基礎の基礎からNGS解析の導入部分まで」をわかりやすくご説明させていただいていることが伝われば幸いです。

余談ですが、生徒役は弊社の新人社員です。彼らの名演技にもご注目ください!
来週には公開できる予定ですので、お楽しみに。

7月開講の「Linux基礎(全6回)」が現在お申込み受付中です。
「Linuxをいちから学んで、NGS解析を始めたい」方はぜひご検討ください。
| hat | スクール | 17:56 | comments(0) | trackbacks(0) |
スクール「Linux基礎」2012年7月期の募集を開始しました
バイオインフォマティクス・スクール「Linux基礎」2012年7月期の募集を開始しました。

第1回 7月14日(土)13:30〜15:30
 Linuxとは

第2回 7月28日(土)13:30〜15:30
 公開データベースおよびツールを活用する方法

第3回 8月11日(土)13:30〜15:30
 ファイルを自由に加工する方法1

第4回 8月25日(土)13:30〜15:30
 ファイルを自由に加工する方法2

第5回 9月08日(土)13:30〜15:30
 次世代シーケンスの公開データおよび解析ツールの活用

第6回 9月29日(土)13:30〜15:30
 次世代シーケンスのデータ解析と応用

詳細およびお申込みにつきましては、弊社スクールのページをご覧ください。

ご参加お待ちしております。
| hat | スクール | 09:36 | comments(0) | trackbacks(0) |
明日がラストです!
いよいよ明日は、バイオインフォマティクス・スクール Linux講座 10月期の最終日です!!


発案・準備からあっという間でした。
反省する点も多々ありましたが、私個人としては、とても有意義な時間を過ごすことができました。

自分の成長やまだまだだな・・と思うことなど、自分自身を見つめなおすいい機会だったと思います。


明日は、大詰めです!
実際に簡単な解析を行っていただきます!



| | スクール | 17:48 | comments(0) | trackbacks(0) |
バイオインフォマティクス・スクール
今週末は、バイオインフォマティクス・スクールのDay3が開講となります。

Day3のテーマは、
「プログラミング言語Perlを使用して、ファイルを加工する方法を学ぼう!」
です。

perlにかかわらず、プログラミングというと、毛嫌いすることがあると思いますが、最小限のperlを覚えることで、研究の幅がグッと広がると思います。

毛嫌いされないような講義を提供できるよう、ただいま大詰め中です。

ご興味がある方は、コチラを参照してください。
| | スクール | 18:04 | comments(0) | trackbacks(0) |
バイオインフォマティクス・スクールの様子
私が講師を務める、バイオインフォマティクス・スクールの様子をお伝えします。

10/22(土)にLinux基礎コースの第1回目のクラスがあったのですが、みなさん少々苦戦していました。

宿題に少々手こずったことと、授業中も実際にコマンドを打っていただくので、タイポ(タイピングミス)で打ち間違ったり、こちらが想定したディレクトリ構成と異なる準備をされていたため、「ファイルが存在しない」というエラーに直面したり・・・。

弊社スタッフが教室内に控えているので、サポートしながらの進行でしたが、2時間半はあっというまに過ぎてしまった感じがします。

終わった後は、みんなでお昼ご飯を食べに行ったりと、和気あいあいとした雰囲気の第1回目のクラスでした。

私にとっても初めての取り組みなので、わからないことばかりですしとても緊張しています。みなさまに助けられながらも、お役に立つ良いサービスを提供していきたいとおもいます。
| 社長 | スクール | 16:39 | comments(0) | trackbacks(0) |
Linux講座に向けて
本日は、弊社で開講予定のバイオインフォマティクス・スクールで、“なぜLinux講座を第1科目として選んだのか”を自分なりにまとめました。
よろしくお願いいたします。

その1:解析ツールの問題
バイオインフォマティクスで使用する解析ツールは、Linux仕様で公開されています。
中には、WindowsやMacなどで使えるツールもありますが、このようなツールは、Linuxで公開されたあと、一般的に使用される状態となって、始めて使用しやすいWindowsおよびMacバージョンで公開されます。

Linuxが使えないと自分で解析したくても、WindowsおよびMacバージョンが出るまで、待つ必要がありますね。

Linuxが使用できる様になると、どのような解析ツールも使用する事ができます。新しいツールが出た際は、自分で試してみる事も可能ですよ!

その2:大量データの扱い
次世代シーケンサーでは、結果として大きな出力データを受け取る場合が多いかと思います。しかしそれらのデータは、Excel等で見る事が困難です。

そのデータの必要な部分だけ見たい!もしくは必要な箇所の結果だけ見たい!という時、Linuxが使用できると、データを自分の思い通りに切り抜き、小さなデータを作成する事が可能です。

小さなデータを作成する事で、得たい情報をExcel等で確認する事ができるようになります!

その3:繰り返し操作の簡易化
Primerを数百個作りたい!とか数万個あるクエリー配列がどの遺伝子に当たるのか確認したい!という時、同じ作業を何度も繰り返す事は、とても気が遠くなるお話だと思います。

Linuxでは、この様な繰り返し作業を自動的にやってくれます。つまり、大変なルーチン作業も1度で終了します。時間も短縮です。



いかがですか?
バイオインフォマティクスをやっていく上で、Linuxとは切っても切れない関係にあるのです。
Linuxの勉強会は、多くありますが、上記の様な事が補えるかというと・・・。

弊社が行うLinux講座では、バイオインフォマティクスに特化した内容となっているため、上記の内容を補う事ができるスクールとなっています。
なかなか怪訝されがちなLinuxですが、私たちと一緒に学んでみませんか?
| | スクール | 20:37 | comments(0) | trackbacks(0) |
2011年10月期「バイオインフォマティクス・スクール」「Linux基礎」は土曜日コースのみ
2011年10月期バイオインフォマティクス・スクールLinux基礎平日コースは、お申し込みが最小人数に達しませんでしたので、開講されないことが決定いたしました。

受講をご検討いただいていたみなさまにはご迷惑をおかけしますが、ご理解の程よろしくお願い申し上げます。

なお、土曜日コースは開講が決まっています。
10/8(土) 10時〜説明会もございますので、お気軽にご参加ください。お待ちしております。
| 社長 | スクール | 19:25 | comments(0) | trackbacks(0) |
第3回バイオインフォマティクス・スクール説明会につきまして
本日は、弊社で開講予定のバイオインフォマティクス・スクールの説明会に関する情報を再度記述させていただきます。

弊社のバイオインフォマティクス・スクールは、バイオインフォマティクスを通した解析技術等を体系的に訓練できる場として提供させていただきます。

クラスの内容や雰囲気などご興味があります方は、説明会・模擬授業にお申し込み下さいませ。
よろしくお願い致します。

【日時】
 10月8日(土) 10時〜11時


お申込みはコチラまでご連絡いただけますよう、よろしくお願いいたします。
| | スクール | 19:07 | comments(0) | trackbacks(0) |
バイオインフォマティクス・スクールの議論!
本日は、10月より開講を予定しておりますバイオインフォマティクス・スクールの内容について、社内ミーティングを行いました。

お客様が何を一番知りたがってて、どういう風にストーリー展開すれば効率的か!!と白熱した議論を交わしました。

身内的な話にはなりますが、スクールの構成、内容、課題など、受講して下さる方々に満足いただける内容になっていると思います!
私も開講がとても楽しみです。

準備も佳境に入ってきました。
ラストスパートです!
| | スクール | 17:59 | comments(0) | trackbacks(0) |
バイオインフォマティクス・スクールに関しまして
本日は、弊社で開講予定のバイオインフォマティクス・スクールに関する追加情報を記述させていただきます。
よろしくお願いします。

先日、弊社のHPおよびブログにてバイオインフォマティクス・スクールに関する記事を掲載させていただきました(HPはコチラブログ記事はコチラを参照)。

“お申し込みが4名様を下回った場合は、開講しません”と記載させて頂いておりましたが、この度、土曜日クラスの開講が決定致しました

ありがとうございます。

また、御申し込みの締め切りは、原則初回クラス日の2週間前とさせていただいております。
そのため、お申し込みの締め切りは

水曜日クラス:10月5日(水)
土曜日クラス:10月8日(土)

となります。
上記以降のお申し込みは、御相談下さい。
内容盛りだくさんです!!

また、クラスの内容や雰囲気などご興味があります方は、説明会・模擬授業を行いますので、お申し込み下さいますよう、よろしくお願いいたします。
【日時】
・9月28日(水) 19時〜20時
・10月1日(土) 14時〜15時
・10月8日(土) 10時〜11時


お問い合わせ、お申し込みはコチラからお願い致します。
| | スクール | 17:52 | comments(0) | trackbacks(0) |
バイオインフォマティクス・スクールを開始します
アメリエフでは、原則偶数月にバイオインフォマティクス勉強会を開催してきましたが、実践にすぐに「使える」ようになるには、座学ではどうしても限界があります。

バイオインフォマティクスは実践を通して訓練することで身に付くという前提にたち、体系的に訓練できる場としてバイオインフォマティクス・スクールをご提供させていただきます。

2ヶ月間で4回のクラス(隔週ペース、1クラス3時間)が1単位です。最初のコースはバイオ研究者のためのLinux入門になります。
初回は10月中旬のスタートです。


進め方ですが、毎回課題が出ます。課題は3時間〜6時間は取り組む必要があります。
クラス内でディスカッションをしながら具体的な課題を進めていただきます。


バイオインフォマティクス・スクールの説明と模擬授業を行いますので、ご興味のあるかたはぜひ参加してみてください。みなさまからのご応募、お待ちしています。

説明会・模擬授業
【日時】
・9月28日(水) 19時〜20時
・10月1日(土) 14時〜15時

【場所】
・アメリエフ株式会社 会議室(9月28日)
・港区立商工会館(10月1日)
(両方とも、東京都立産業貿易センター 浜松町館6階です。)

【お申し込み・お問い合わせ】
こちらまで
| 社長 | スクール | 19:16 | comments(0) | trackbacks(0) |
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031    
<< January 2017 >>

このページの先頭へ