アメリエフのブログ

バイオインフォマティクスの紹介と社員の日々
第46回バイオインフォマティクス勉強会「10x Genomicsによるロングリード解析@東京」開催のお知らせ
9月9日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

《内容》

10x Genomicsが開発したGemCodeシステムは、ショートリードから擬似的にロングリードを生成する革新的な技術です。
本勉強会では、日本で10x Genomicsのサービスを提供する3社をお招きし、実験から解析までトータルにご紹介いたします。

  • 10x Genomics社のChromiumシステムのご紹介 株式会社スクラム社 掛谷 知志 様
  • Chromium向けターゲットエンリッチメント試薬のご紹介 アジレント社 吉崎 史子 様
  • 受託解析サービスのご紹介 受託解析会社 ご担当者 様
  • データ解析のご紹介 アメリエフ 山口 昌雄

10x Genomicsの技術にご興味のある方、お試しされたい方、導入をご検討されている方などご参加をお待ちしております。

             記

【日時】2016年9月9日(金) 15:30-16:45 (受付開始 15:00〜)
【場所】東京都港区芝四丁目1-17 三田いきいきプラザ 集会室A(洋室)
【アクセス】
・地下鉄三田線・浅草線 三田駅 A9番出口 徒歩1分
・JR山手線・京浜東北線 田町駅 西口 徒歩8分
【定員】 30名
【対象】
・これからNGSを用いたロングリード解析をラボまたは委託で始めたい方
・10x Genomics社製品に興味がある方
・NGSを使ったロングリード解析に興味がある方
【お申込みフォーム】こちら
【お申込み締切】 9月8日(木)正午まで

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、上記URLからお早めにお申し込みください。

勉強会の後には、近くの飲食店にて情報交換会(実費 3,000〜4,000円)を
企画しております。講師も参加いたしますので、情報交換や横のつながりを
作る機会として、お楽しみいただければと思います。
| kubo | 勉強会 | 09:57 | comments(0) | - |
フリーソフトで始める融合遺伝子解析入門
2016年5月20日に開催した第44回、および27日に開催した第45回バイオインフォマティクス勉強会の
「フリーソフトではじめるNGS融合遺伝子解析入門」の資料を、一部修正してSlideShareに公開いたしました。
RNA-seqの基本的な解析方法にはじまり、融合遺伝子解析ソフトのTopHat-Fusionの使い方をコマンドを交えてご紹介しています。

弊社へ解析の依頼を検討されている方は弊社Webサイトの受託解析のページを、ご自身で解析したい方はトレーニングNGS解析サーバのページを、ぜひ一度ご覧ください!
| onouek | 勉強会 | 14:24 | comments(0) | - |
第44回・第45回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるNGS融合遺伝子解析入門」開催のお知らせ
5月20日、5月27日に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
(東京開催、大阪開催とも同様の内容となります。)

《講師》
山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)
尾上 広祐 (バイオインフォマティクス事業部データ解析担当)

《内容》
RNA-seqのシーケンスデータからオープンソースソフトウェアTopHat-fusionを用いて融合遺伝子を検出し、遺伝子アノテーションを付与する方法について、Linuxを用いたフリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。

                 記

◆大阪開催◆
日時 :2016年5月20日(金) 16:30-17:30 (受付開始 16:15〜)
場所 :リバネス 大阪事業所
    〒541-0041 大阪市中央区北浜1-5-7 北浜MDビル2階
定員 :20名
参加費:1,000円(消費税込)学生 500円(消費税込)
対象 :・これからNGS解析を始めたい方
    ・NGSを使った融合遺伝子検出について、よく知らないが興味がある方
形式 :講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)
お申込み:http://goo.gl/forms/og4ahw81sZ
     【お申込み締切:5月18日(水)正午まで】

◆東京開催◆
日時 :2016年5月27日(金) 17:45-18:45 (受付開始 17:30〜)
場所 :三田いきいきプラザ 2階 集会室A
    〒108-0014 東京都港区芝四丁目1-17 三田いきいきプラザ
定員 :30名
参加費:1,000円(消費税込) 学生 500円(消費税込)
対象 :・これからNGS解析を始めたい方
    ・NGSを使った融合遺伝子検出について、よく知らないが興味がある方
形式 :講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)
お申込み:http://goo.gl/forms/og4ahw81sZ
    【お申込み締切:5月25日(水)正午まで】

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。 電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。

勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。
みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| ymm | 勉強会 | 17:37 | comments(0) | - |
<バイオインフォマティクス講習会@神戸>Bio-Linux 8のインストールに関する補足情報 
先日ご案内いたしました5月20日の講習会では、仮想環境を
事前インストールしていただくことでLinuxを体験しながら
受講することができます!

環境構築に当たりまして、インストールの詳細な手順を記載している資料を補足情報としてご案内いたします。

こちらの資料は東京大学 大学院農学生命科学研究科 門田 幸二先生のホームページにて公開されているものをご紹介しております。

仮想マシンの作成、およびBio-Linux 8のインストール
●Windows版
http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/book/JSLAB2_BioLinux8_iso_win.pdf

●Macintosh版
http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/book/JSLAB2_BioLinux8_iso_mac.pdf

現在、お陰様で20名様を超えるお申し込みをいただいておりますが
引き続き、皆様のお申し込みをお待ちしております!

☆講習会の詳細はこちら⇒ http://amelieff.jp/?p=4376
| ymm | 勉強会 | 10:22 | comments(0) | - |
バイオインフォマティクス講習会@神戸「アメリエフのバイオインフォマティクストレーニングを体験」開催のお知らせ
5月20日に開かれるバイオインフォマティクス講習会のご案内です。

《内容》
アメリエフで提供している「トレーニング」をたくさんの方に知っていただくため、トレーニングを体験できる講習会を企画いたしました。

お手持ちのPC(Mac / Linux)でNGS 解析を始めたい方に、Linux の基本操作からNGSデータ解析でよく利用されるフリーソフトの使い方、データ解析手法をご紹介します。
本セミナーでご紹介するコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS 解析でご活用いただければと思います。

講習会開催にあたっては、理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター 工樂 樹洋先生、医学生物学研究所(MBL)様にご協力いただいております。

日時:2015年5月20日(水) 16:30-18:00 (受付開始 16:15〜)
場所: 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター(CDB)C棟 4階 C-S401号室
(兵庫県神戸市中央区港島南町2-2-3)
参加費用:無料

講習会の後には、「理研神戸 NGS施設見学会」(最大20分)と施設内での情報交換会(実費:2,000円)を予定しております。詳細はお申し込みをされた方に後日お知らせいたします。
情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す方は奮ってご参加ください。

☆詳細はこちら ⇒ バイオインフォマティクス講習会@神戸
☆お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/forms/qP62qylPj9
          【お申込み締切:5月18日(月)正午まで】
| ymm | 勉強会 | 13:07 | comments(0) | - |
公開データベース活用編
2015年2月14日に開催した第41回バイオインフォマティクス勉強会、および21日に開催した第42回バイオインフォマティクス勉強会の「フリーソフトではじめるNGS解析入門〜Exomeシーケンスからクリニカルシーケンスまで〜」の資料を、一部修正して、「公開データベース活用編」としてSlideShareにて公開いたしました。
ClinVar、HGVD、dbSNFPなどデータベースのほか、データベースから疾患関連の変異を予測するアルゴリズムを紹介しています。

NGSで変異検出まではしたけど、疾患に関する変異はどうやって探したらいいの? と困っている方のご参考になりましたら幸いです。
| kubo | 勉強会 | 14:55 | comments(0) | - |
第42回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるNGS解析入門@大阪〜Exomeシーケンスからクリニカルシーケンスまで〜」開催のお知らせ
2月21日に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
(2月14日(土)東京開催の勉強会と同様の内容となります。)

《内容》
ゲノムのシーケンスデータから得られた大量のSNV/Indelを効率よく活用するために、フィルタリング・分類・蓄積する方法について、Linuxを用いたフリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。今回は特に、公開されているデータベースを用いた絞り込みを行う上でポイントとなる解析手法をご紹介します。
この勉強会はMBL(医学生物学研究所)様との共催となります。


日時:2015年2月21日(土) 15:30-16:50 (受付開始 15:15〜)
場所:コンベンションルーム・AP大阪梅田茶屋町
(大阪府大阪市北区茶屋町1番27号 ABC-MART梅田ビル8F)
参加費用:1,000円(消費税込)


勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。
情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す方は奮ってご参加ください!


☆詳細はこちら ⇒ 第42回バイオインフォマティクス勉強会
☆お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/forms/9KKT3j6G0j
          【お申込み締切:2月19日(木)正午まで】
| ymm | 勉強会 | 17:38 | comments(0) | - |
第41回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるNGS解析入門@東京 〜Exomeシーケンスからクリニカルシーケンスまで〜」開催のお知らせ
2015.1.29 ご好評につき、参加希望人数が定員に達したため「キャンセル待ち」とさせていただきます。また、同様の内容で2月21日(土)にも大阪開催が決定いたしましたので、よろしければそちらもご検討ください。

2月14日に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

ゲノムのシーケンスデータから得られた大量のSNV/Indelを効率よく活用するために、フィルタリング・分類・蓄積する方法について、Linuxを用いたフリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。今回は特に、公開されているデータベースを用いた絞り込みを行う上でポイントとなる解析手法をご紹介します。

日時:2015年2月14日(土) 15:30-16:50 (受付開始 15:15〜)
場所:神田公園区民館 5階B会議室 (神田司町2-2)
参加費用:¥1,000(消費税込み)


勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。
情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す方は奮ってご参加ください!

☆詳細はこちら ⇒ 第41回バイオインフォマティクス勉強会
☆お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/forms/7QcyJkhVfz
          【お申込み締切:2月12日(木)正午まで】
| ymm | 勉強会 | 11:14 | comments(0) | - |
フリーソフトではじめるChIP-seq解析
第40回勉強会他で使用した「フリーソフトではじめるChIP-seq解析」の資料をSlideShareにアップロードしました。
次世代シーケンスリードのQCから、ゲノムマッピング、ChIP-seqピーク検出ソフトMACSの使い方まで、コマンドを交えてご紹介しています。


解析をご検討されている方は、弊社Webサイトの受託解析を、
ご自身で解析したい方は、トレーニングや、NGS解析サーバを、
ぜひ一度ご覧くださいおてんき
| hat | 勉強会 | 10:44 | comments(0) | - |
第40回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるChIP-seq&メチル化データ解析入門@福岡」開催のお知らせ
12月18日(木)に、福岡朝日ビルB1 15号で開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
今回の勉強会では、九州大学 生体防御医学研究所の須山先生にご講演いただきます。

これからNGS解析(特にChIP-seqデータ解析とメチル化データ解析)を始めたい方を対象に、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。
九州大学 須山先生には、次世代シーケンサから出力される大規模なデータをどのように解析し、活用するかを豊富なご経験から紹介いただきます。
アメリエフからはChIP-seqデータのデータ解析手法とSeqCap Epi CpGiant Enrichment Kit(Roche社) を用いてエンリッチメントされたサンプルのシーケンスデータ(illumina社のNGSを使用)のメチル化データ解析手法をご紹介いたします。

詳細はこちらでご確認ください。

お申込はこちら 【お申込み締切:12月16日(火)正午まで】
| kubo | 勉強会 | 11:31 | comments(0) | - |
12月上旬に開催!バイオインフォマティクス勉強会のお知らせ
これからNGS解析(特にChIP-seqデータ解析とメチル化データ解析)を始めたい方を対象に、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。今回は特に、SeqCap Epi CpGiant Enrichment Kit(Roche社)を用いてエンリッチメントされたサンプルのシーケンスデータ(illumina社のNGSを使用)のメチル化データ解析手法をご紹介いたします。

東京開催では、まずロシュ・ダイアグノスティックス株式会社のご担当者様から、この製品の特徴などを紹介いただく予定です。
勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す限り、ぜひご参加ください。

《京都開催》
開催日:2014年12月5日(金)15:30〜16:50(受付開始 15:15〜)
場 所ハートピア京都 第3会議室
参加費:1,000円(税込み)

《京都開催》
開催日:2014年12月6日(土)10:30〜11:50(受付開始 10:15〜)
場 所文京区シビック 区民会議室5階 会議室A
参加費:1,000円(税込み)

☆詳細はこちら⇒第38回/第39回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるChIP-seq&メチル化データ解析入門」開催のお知らせ

☆お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/GWUBjk
【お申込み締切:12月4日(木)正午まで】
| akb | 勉強会 | 10:30 | comments(0) | - |
9月22日開催「次世代シーケンス解析 大勉強会」のお知らせ
2009年の創業以来、「実践的な学びと人のつながりを生み出す場」を目指し開催して参りました、バイオインフォマティクス勉強会も、みなさまに支えられ37回を数えるまでになりました。

今回の"大"勉強会では、これまでの勉強会とは趣向を変え、4名の先生をお招きし、次世代シーケンサーを用いた研究事例を、WetとDryそれぞれの視点でご紹介いただきます
また、みなさまの交流の時間も設けておりますので、情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。社員一同お会いできることを楽しみにしています。
ご意見・ご質問・リクエスト等がございましたら、遠慮無くご連絡ください。

開催日:2014年9月22日(月)10:30〜16:45(受付開始 9:30)
場 所:関東ITソフトウェア健康保険組合 山王健保会館・会議室(東京都港区赤坂2-5-6)
参加費:無料(お弁当付き)


☆詳細はこちら⇒「次世代シーケンス解析 大勉強会」開催のお知らせ
☆お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/SFdkwL
【お申込み締切:9月17日(水)正午まで】
| akb | 勉強会 | 12:15 | comments(0) | - |
7月31日(木)、8月1日(金)休業のお知らせ
平素よりアメリエフ株式会社のサービスをご利用頂きまして、誠にありがとうございます。
全社研修による休業のお知らせです。

【休業期間】
2014年7月31日(木)12:00〜18:00
2014年8月1日(金)9:00〜18:00
【営業開始】
2014年8月4日(月)より通常営業

お問い合わせにつきましては、8月4日以降に順次対応させていただきます。
ご不便をおかけ致しますが、何卒ご了承くださいますよう宜しくお願いいたします
| akb | 勉強会 | 09:55 | comments(0) | - |
第32回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析@福岡」開催のお知らせ
6月6日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。好評につきまして、東京/神戸会場でご紹介いたしました「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門」を福岡にて開催いたします。

《講師》
 山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
Linux PCでNGS解析(特にRNA-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、本セミナーでご紹介する主なソフトウェアはTopHat、Cufflinks、Rなどです。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。
会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

               記
日時 :2014年6月6日(金) 15:30-17:00
   (受付開始 15:00〜)
場所 :福岡朝日ビルB1 12号室 (福岡市博多区博多駅前2-1-1)
地図 :http://www.asahibuilding.co.jp/fukuoka_access.html
定員 :60名
対象:これからRNA-seq解析を始める方/Linux初心者の方
形式:講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/Oe5ZaO

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 14:46 | comments(0) | - |
バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析、ChIP-seq解析入門」開催のお知らせ
3/28(金)に開かれる、バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析、ChIP-seq解析入門」のご案内です。今回の勉強会は、理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニットの二階堂 愛 先生のご協力をいただいて開催いたします。

《構成》
 第一部:13:00〜14:30 RNA-seq解析
 第二部:15:00〜16:30 ChIP-seq解析

《講師》
 山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
Linux PCでNGS解析(特にRNA-seq、ChIP-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

               記
日時 :2014年3月28日(金) 13:00〜16:30
   (受付開始 12:30〜)
場所 :理化学研究所和光キャンパス BSI池の端研究棟3階大会議室
地図 :http://www.riken.jp/access/wako-map/#anchor2
定員 :120名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に情報交換会を開きますので、ぜひ参加をご検討ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 14:46 | comments(0) | - |
第30回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門@神戸」開催のお知らせ
3月15日(土)に開かれる第30回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
好評につきまして、東京会場でご紹介いたしました「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門」を神戸会場にて開催いたします。

Linux PCでNGS解析(特にRNA-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、本セミナーでご紹介する主なソフトウェアはTopHat、Cufflinks、Rなどです。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。
勉強会後には情報交換会も予定しております。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

               記
日時 :2014年3月15日(土) 15:30〜17:00
場所 :関西事業所 (兵庫県神戸市中央区港島中町2-1-12北埠頭ビル 3階)
地図 :http://www.om-kobe.co.jp/office_kitafuto.html
定員 :30名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に情報交換会を開きますので、ぜひ参加をご検討ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 16:13 | comments(0) | - |
第29回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門@東京」開催のお知らせ
2月15日(土)に開かれる第29回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

お手持ちのPC(Mac/Linux)でNGS解析(特にRNA-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、本セミナーでご紹介する主なソフトウェアはTopHat、Cufflinks、Rなどです。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。
勉強会後には情報交換会、会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

               記
日時 :2014年2月15日(土) 10:00〜11:30
場所 :文京区 区民センター (東京都文京区本郷4-15-14 3-D会議室)
地図 :http://www.city.bunkyo.lg.jp/gmap/detail.php?id=1754
定員 :30名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に情報交換会を開きますので、ぜひ参加をご検討ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 16:01 | comments(0) | - |
第28回バイオインフォマティクス勉強会「NGSデータ解析サーバ体験セミナー」満員御礼
第28回バイオインフォマティクス勉強会「NGSデータ解析サーバ体験セミナー」はお申込みが定員に達しましたのでキャンセル待ちとさせていただいております。

たくさんのお申込み、ありがとうございました!
| akb | 勉強会 | 17:10 | comments(0) | - |
第27回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるゲノム解析@神戸」満員御礼
第27回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるゲノム解析@神戸」はお申込みが定員に達しましたのでキャンセル待ちとさせていただいております。

たくさんのお申込み、ありがとうございました!
| akb | 勉強会 | 18:32 | comments(0) | - |
第26回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるゲノム解析@東京」開催のお知らせ
第26回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
NGS現場の会 第三回研究会でご好評いただいた内容を、10月に東京で、11月に神戸で開催いたします。

お手持ちのPC(Mac/Linux)でNGS解析を始めたい方に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、ご紹介する解析パイプラインは1000 Genomes Projectで用いられた、実績のある手法です。
本セミナーでご紹介するコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。
勉強会後には情報交換会、会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

               記
日時 :2013年10月12日(土) 15:30〜17:00
場所 :港区立商工会館 会議室(東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図 :http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員 :40名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に情報交換会を開きますので、ぜひ参加をご検討ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 15:30 | comments(0) | - |
第24回バイオインフォマティクス勉強会「SNPデータ解析入門@神戸」開催のお知らせ
第24回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
昨年12月に東京で好評だった「SNPデータ解析入門」を神戸会場にて開催いたします。

タイリングアレイ(Microarray)や次世代シーケンサー(NGS)により得られたSNPタイピング情報から、GWAS解析や連鎖解析などの遺伝統計解析の実践につきまして、ご紹介させていただきます。また、PLINKなどのフリーの解析ツールや実際のコマンドもご紹介させていただきます。勉強会後には情報交換会、会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

               記
日時 :2013年7月13日(土) 15:30〜17:00
場所 :関西事業所 (兵庫県神戸市中央区港島中町2-1-12北埠頭ビル 3階)
地図 :http://www.om-kobe.co.jp/office_kitafuto.html
定員 :16名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に情報交換会を開きますので、ぜひ参加をご検討ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 17:09 | comments(0) | - |
第22回バイオインフォマティクス勉強会「Exomeデータ解析入門@東京」開催のお知らせ
第22回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
今回の勉強会は下記の2部構成で開講させていただきます。

第一部:「はじめてのLinux」
第二部:「Exomeデータ解析入門@東京」


第一部はLinuxの超入門編です。基本的なコマンド操作の方法をご紹介いたします。
第二部では、メンデル遺伝病の疾患関連遺伝子探索を目的としたExomeデータ解析を中心に、解析のポイントや、検出されたSNVおよびIndelを用いた遺伝統計解析までをご紹介する予定です。Exome解析を行われている方やご検討されている方との貴重な情報交換の場にしたいと考えております。この機会に奮ってご参加ください。

               記
日時 :2013年4月6日(土) 14:45〜17:00
場所 :東京ライフサイエンスインキュベーションセンター会議室A(東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図 :http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員 :24名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に懇親会を開きますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。

※解析経験をお持ちの方は、第二部からの参加をおすすめいたします

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 11:12 | comments(0) | trackbacks(0) |
第21回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR活用講座」 満員御礼
第21回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR活用講座」はお申込みが定員に達しましたのでキャンセル待ちとさせていただいております。

たくさんのお申込み、ありがとうございました!
| akb | 勉強会 | 09:42 | comments(0) | trackbacks(0) |
第21回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR活用講座」 空席僅かです
既にアナウンスさせていただいておりますが、
3/23(土)に第21回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR活用講座」を開催いたします。

たくさんの方にお申し込みをいただきありがとうございました。
空席残り僅かですので、ご検討中の方はお早めにお申込みください。
| akb | 勉強会 | 19:10 | comments(0) | trackbacks(0) |
第21回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR活用講座」開催のお知らせ
今回の勉強会では、アレイ解析、GWAS、NGS解析、検定における
統計解析パッケージRの活用方法を実例を交えてご紹介いたします。

              記

日時:2013年3月23日(土) 15:30〜17:00
場所:東京ライフサイエンスインキュベーションセンター会議室A
          (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員:24名

また、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。予算は4,000円(予定)です。

参加をご希望の方は、お問い合わせページにてお早めにお申し込みください。
勉強会(15:30〜17:00) ○
懇親会(17:30〜) ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 10:28 | comments(0) | trackbacks(0) |
第20回バイオインフォマティクス勉強会「Exomeデータ解析入門」開催のお知らせ
第20回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
今回の勉強会では、多因子疾患のRare Variant探索を目的とした『Exomeデータ解析』を中心にご紹介したいとおもいます。
さらに、株式会社KMデータの谷口様をお招きして、Exome解析から得られた遺伝子の機能解析についてお話いただく予定です。

               記
日時 :2013年1月19日(土) 15:30〜17:00
場所 :東京ライフサイエンスインキュベーションセンター会議室A(東京     都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図 :http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員 :24名

お申込み方法などの詳細はこちらをご参照ください。勉強会後に懇親会を開きますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。

今回の勉強会はUstreamにてライブ配信いたします。
http://www.ustream.tv/channel/amelieff

勉強会前(13:30〜14:30)には、会社説明会 in 東京を開催いたします。参加をご希望の方は、こちらをご参照のうえ、申込み下さい。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 11:15 | comments(0) | trackbacks(0) |
「SNPデータ解析入門」 本日14:45〜 On Air
本日12/15(土)のバイオインフォマティクス勉強会を
以下のURLからUstream配信します。
http://www.ustream.tv/channel/amelieff

使用スライドをSlideShareにUpしましたので、
小さい字が見づらい場合はこちらもご覧ください。

14:45-15:15
「はじめてのLinux〜コンパウンドヘテロを探してみよう〜」
 →SlideShare

15:30-17:00
「SNPデータ解析入門」
 →SlideShare

あいにくの雨模様ですので、会場にお越しになる方は
どうぞお気をつけてお越しください。
| hat | 勉強会 | 13:34 | comments(0) | trackbacks(0) |
「SNPデータ解析入門」 満員御礼
明日開催の第19回バイオインフォマティクス勉強会「SNPデータ解析入門」はお申込みが定員に達しましたのでキャンセル待ちとさせていただいております。

たくさんのお申込み、ありがとうございました!
| hat | 勉強会 | 15:03 | comments(0) | trackbacks(0) |
「SNPデータ解析入門」 空席僅かです
既にアナウンスさせていただいておりますが、
今週末12/15(土)に
第19回 バイオインフォマティクス勉強会「SNPデータ解析入門」
を開催します。

たくさんの方にお申し込みをいただきありがとうございました。
あと2〜3名はお席をご用意できますので、
ご検討中の方はお早めにお申込みください。

今回初の試みとして、勉強会の内容をUstream配信します。
会場にはお越しになれないがご興味はあるという方に
ぜひご視聴いただきたいです。

配信URLはこちらです。
http://www.ustream.tv/channel/amelieff

※スライドは開始前に弊社のSlideShareページにも
 Upさせていただく予定です。
 スライドが見づらい場合は、こちらも併せてご覧ください。

また、一般公開したくない情報や質疑応答中などは
配信を中断させていただくことがございますので、
ご了承ください。

社内でテストしたところ、パソコンによっては
IEで映像が表示されない場合がありました。
視聴がうまくいかない場合は、他のブラウザも
試していただけますと幸いです。

それではみなさまのご来場(&ご視聴)をお待ちしています。
| hat | 勉強会 | 09:45 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】SNPデータ解析入門
12月15日(土)に開かれる第19回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
今回の勉強会は下記の2部構成で開講させていただきます。

第一部:「はじめてのLinux〜コンパウンドヘテロを探してみよう〜」
第二部:「SNPデータ解析入門」

第一部はLinuxの超入門編です。基本的なコマンド操作の方法をご紹介いたします。
第二部では、タイリングアレイ(Microarray)や次世代シーケンサー(NGS)により得られたSNPタイピング情報から、GWAS解析や連鎖解析などの遺伝統計解析の実践につきまして、ご紹介させていただきます。
また、PLINKなどのフリーの解析ツールや実際のコマンドもご紹介させていただきます。

              記
日時: 2012年12月15日(土) 14:45〜17:00
場所:東京ライフサイエンスインキュベーションセンター会議室A
   (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員:24名


プロジェクターで投影しながら進行していきます。ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。

今回の勉強会はUstreamにてライブ配信いたします。

公開予定の映像への映り込み等の可能性につきましては、予めご理解頂いた上でのご参加をお願い致します。
音声と資料のみの配信となりますが、遠方のため勉強会へ参加できない方は、ぜひご覧ください。
URLはこちらになります。

http://www.ustream.tv/channel/amelieff
※Chromeブラウザにて動作確認を行っております。その他のブラウザをご利用の場合、正しく動作しない可能性があります。あらかじめご了承ください。
また、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。予算は4,000円(予定)です。
参加をご希望の方は、お問い合わせページにてお早めにお申し込みください。
第一部(14:45〜15:15) ○
第二部(15:30〜17:00) ○
懇親会(17:30〜) ○

※解析経験をお持ちの方は、第二部からの参加をおすすめいたします。
みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。
| akb | 勉強会 | 16:00 | comments(0) | trackbacks(0) |
第18回勉強会【ChIP-seqデータ解析入門】
10月20日(土)に開催される、【第18回バイオインフォマティクス勉強会】のご案内です。
今回のテーマは、「ChIP-seqデータ解析入門」です。

ChIP-seq(クロマチン免疫沈降法によるNGSシーケンス)結果のデータ解析につきまして、流れやコマンドラインなどをご紹介する予定です。

また、扱うhumanのChIP-seqデータは全て公開されていますので、配付資料を用いて研究室内で同様のデータ解析を行うことができます。

詳細はニュースをご覧ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| hat | 勉強会 | 13:51 | comments(0) | trackbacks(0) |
「Exome解析」にご参加ありがとうございました
9/1(土)に東北大学 長正朗教授をご招待して開催した、バイオインフォマティクス勉強会「Exome解析」が大盛況のうちに終了しました。

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長崎先生には、クオリティコントロールの注意点やマッピングソフトウェアの比較結果をはじめとした貴重なノウハウをご紹介いただき、非常に勉強になりました。

勉強会の熱気が冷めやらぬまま、懇親会も多くの方にご参加いただき、とても盛り上がりました。

お忙しい中ご参加してくださった皆さま、本当にありがとうございました。

次回の勉強会、9/22(土)【Exomeデータ解析入門】@大阪は現在お申込み受付中です。
関西で次世代シーケンシング解析をご検討中/実施されている皆さまとの情報交換の場にさせていただきたいと考えております。
たくさんのご参加をお待ちしております!
| hat | 勉強会 | 11:25 | comments(0) | trackbacks(0) |
明日は「Exome解析」です
明日は東北大学 長正朗教授に「Exome解析」についてご講演いただきます。
おかげさまでたくさんのお申し込みをいただき、ありがとうございました。
長先生のお話を伺えるのを、社員一同とても楽しみにしております。

ところで、今日は今月2回目の満月です。
ひとつきに2回満月がめぐってくるのは非常に珍しいことだそうです。
天気が悪くない地域の方は、今日のお仕事帰りに夜空を見上げてみてはいかがでしょうか。
| hat | 勉強会 | 16:23 | comments(0) | trackbacks(0) |
第17回勉強会【Exomeデータ解析入門】@大阪
7月に東京で開催してご好評だった「Exomeデータ解析入門」を、9月22日(土)に大阪・ブリーゼプラザでも開催します。

メンデル遺伝病の疾患関連遺伝子探索を目的としたExomeデータ解析を中心に、最近注目されているデコイ配列の利用や、SNVのフィルタリング、アノテーション付けまでをご紹介する予定です。

関西でExome解析を行われている方やご検討されている方たちとの貴重な情報交換の場にしたいと考えております。
この機会に奮ってご参加ください。

詳細はニュースをご覧ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| hat | 勉強会 | 12:15 | comments(0) | trackbacks(0) |
第15回勉強会「NGSによるDNAメチル化データ解析入門」当日参加受付中
バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

明日8月18日(土)に第15回バイオインフォマティクス勉強会「NGSによるDNAメチル化データ解析入門」を開催します。
DNAメチル化データ解析につきまして、解析手法やノウハウをご紹介します。

お申込みいただきました方々へこの場を借りて深く御礼を申し上げます。
当日参加も受け付けておりますので、ご興味のある方はお越しいただけましたら幸いです。

詳細はニュースをご覧ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| akb | 勉強会 | 17:06 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】Exome解析
バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

9月1日(土)に第16回バイオインフォマティクス勉強会
「Exome解析」を開催します。

東北大学 東北メディカルメガバンクゲノム解析部門 長正朗教授をお招きして、Exome解析についてお話しいただく予定です。

詳細は、ニュースをご覧ください。

たくさんのご参加をお待ちしております。
| hat | 勉強会 | 12:10 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】NGSによるDNAメチル化データ解析入門
バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

8月18日(土)に第15回バイオインフォマティクス勉強会
「NGSによるDNAメチル化データ解析入門」を開催します。

NGSによるバイサルファイトシーケンス結果からの
データ解析の流れをご紹介する予定です。

詳細は、ニュースをご覧ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| hat | 勉強会 | 10:17 | comments(0) | trackbacks(0) |
七夕には...
こんにちは、hatです。
道端で短冊をぶら下げた笹を見かけて、もうすぐ七夕なんだなあと思いました。
今年の七夕は晴れて、織姫と彦星が会えるといいですね。

さて、そんな七夕の7月7日に、
第14回バイオインフォマティクス勉強会「Exomeデータ解析入門
を開催します。
今回はメンデル遺伝病の疾患関連遺伝子探索を目的としたExomeデータ解析を中心に取り上げたいとおもいます。

おかげさまで多数のお申し込みをいただいておりますが、今回はキャパシティの広い会場をご用意したため、まだお申込み可能です。
Exome解析にご興味ある方は、ぜひご参加ください!
| hat | 勉強会 | 18:18 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】Exomeデータ解析入門
バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

7月7日(土)に第14回バイオインフォマティクス勉強会
「Exomeデータ解析入門」を開催します。

3月の勉強会ではがんゲノムに焦点をしぼりましたが、今回はメンデル遺伝病の疾患関連遺伝子探索を目的としたExomeデータ解析を中心に取り上げたいとおもいます。

最近注目されているデコイ配列の利用や、SNVのフィルタリング、アノテーション付けまでをご紹介する予定です。
詳細は、ニュースをご覧ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| hat | 勉強会 | 12:54 | comments(0) | trackbacks(0) |
第13回バイオインフォマティクス勉強会「RNA-seqデータ解析入門」は定員に達しました
第13回バイオインフォマティクス勉強会「RNA-seqデータ解析入門」は
お申込みが定員に達したため、現在キャンセル待ちとさせていただいております。

たくさんのお申込み、ありがとうございました!
| hat | 勉強会 | 16:07 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】RNA-seqデータ解析入門
バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

6月2日(土)に第13回バイオインフォマティクス勉強会
RNA-seqデータ解析入門」を開催します。

ご要望の大変多かったRNA-seqデータ解析につきまして、
データ解析の手法やノウハウをご紹介したいとおもいます。

詳細は、ニュースをご覧ください。

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| hat | 勉強会 | 15:09 | comments(0) | trackbacks(0) |
がんゲノムのExome解析
3/3(土)に開かれた、バイオインフォマティクス勉強会「がんゲノムのExome解析入門」が無事に終了しました。

予想以上に反響が大きくて、募集開始から3日で定員の24席が満席となってしまいました。初めてお目に掛かる方も多くて、注目度の高さを目の当たりにしました。


メンデル遺伝の疾患モデルを対象としたExomeデータ解析は、現時点では比較的情報が得られやすくなっていますが、がんの場合は論文はある程度公開されていますが、具体的にどのようにデータ解析を行うのかという情報が少なく、また確立された手法でもないため、みなさん苦労をされている様子でした。


我々も論文を読み解きながら3〜4ヶ月間ほど試行錯誤を繰り返しましたが、ある程度めどが立ったので気をつけるべき点や、実際のコマンドやパラメーターも含めてご説明させていただきました。

少しでもご研究のお役にたつことができましたら幸いです。



勉強会も盛り上がりましたが、その後の懇親会はさらに大盛り上がりでした!
10名以上のかたがご参加してくださったのですが、研究業界の情報など幅広い話題が出て、横の繋がりが得られる貴重な機会となりました。

お忙しい中でご参加してくださった皆さま、本当にありがとうございました。
| 社長 | 勉強会 | 00:46 | comments(0) | trackbacks(0) |
【第12回バイオインフォマティクス勉強会】3/3(土)がんゲノムのExome解析入門
3/3(土)に開催いたします第12回バイオインフォマティクス勉強会に、多くの皆さまからのお申し込みをいただきまして、誠にありがとうございました。

予想を上回るお申し込みをいただき、定員の24名となってしまいました。
お椅子のみのご用意となってしまいますが、急遽定員を2名増やして26名とさせていただきました。


定員になり次第、締め切りとさせていただきますので、ご了承くださいますようお願い致します。

| 事務担当Y | 勉強会 | 13:53 | comments(0) | trackbacks(0) |
【締切】12/17(土)ChIP-seqデータ解析入門
12月17日(土)に開催される第11回バイオインフォマティクス勉強会「ChIP-seqデータ解析入門」は、お申込み数が定員の24名となりましたので、募集を締め切らせていただきます。

多数のお申込みをいただきまして、誠にありがとうございました。

お申込みをいただきました皆様、当日お会いできます事を、楽しみにしております。
| 事務担当Y | 勉強会 | 12:53 | comments(0) | trackbacks(0) |
第11回バイオインフォマティクス勉強会の日付が12/17に変更になりました
当初、12/10(土)に開催すると発表していました「第11回バイオインフォマティクス勉強会」ですが、12/17(土)へと変更になりましたのでお知らせいたします。

ご迷惑をおかけし申し訳ございません。
よろしくお願い申し上げます。

山口
| 社長 | 勉強会 | 16:55 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】SNPデータ解析入門
10月1日(土)に開かれる第10回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

今回のテーマは、「SNPデータ解析入門」です。

タイリングアレイ(Microarray)や次世代シーケンサー(NGS)により得られたSNPタイピング情報から、GWAS解析や連鎖解析などの遺伝統計解析の実践につきまして、ご紹介させていただきます。

また、PLINKなどのフリーの解析ツールや実際のコマンドもご紹介させていただきます。

              記
日時: 2011年10月1日(土) 15:30〜17:00
場所:港区立商工会館 会議室
   (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員:24名
テキスト代:お一人 500円(当日受付にてお支払いください)

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。


また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。
予算は4,000円です。

どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、お問い合わせからお早めにお申し込みください。

勉強会(15:30〜17:00)  ○
懇親会(17:30〜)     ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。

アメリエフ株式会社
代表取締役社長 山口 昌雄
| 社長 | 勉強会 | 15:48 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】Ion Torrent入門
8月26日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会の御案内です。

今回は、「Ion Torrent入門」と題しまして、
ライフテクノロジーズジャパン株式会社様の御協力のもと、2部構成とさせていただきました。

【プログラム】
第1部「Ion Torrentの技術的な解説」(担当:ライフテクノロジーズジャパン様)、
第2部「Ion Torrentデータを用いた多型解析」(担当:アメリエフ)です。

Ion Torrentから得られたデータから、多型情報(SNPやIndelなど)を抽出し、データ解析を行います。多型情報を得るまでに必要なファイル操作及びフリーの
解析ツールを用いた操作を実際のコマンドも交えて御紹介させていただきます。

              記
日時: 2011年8月26日(金) 16:00〜17:30(第1部:45分、第2部:45分)
場所:東京ライフサイエンスインキュベーションオフィス 会議室A
   (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員:24名
会費:無料

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。
WiMAXは感度良好のお部屋です。

お申し込みはコチラ

また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。
予算は4,000円です。

どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
8/24(水)までにお申し込みをお願いいたします。

勉強会(16:00〜17:30)   ○
懇親会(18:00〜)      ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| | 勉強会 | 17:12 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】MiSeq入門
明日8月5日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会を再度御案内させていただきます。

今回の勉強会は、「MiSeq入門」と題しまして、イルミナ株式会社様の御協力のもと、2部構成とさせていただきました。

第1部「MiSeqの技術的な解説」(担当:イルミナ株式会社様)
第2部「MiSeqデータを用いた多型解析」(担当:アメリエフ株式会社)

日時:2011年8月5日(金) 16:00〜17:30(第1部:45分、第2部:45分)
場所:東京ライフサイエンスインキュベーションオフィス 会議室A
   (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
会費:無料

勉強会は、明日ですが、まだ空席もございますので、興味のある方は、ぜひご参加ください!!
お申し込みはコチラからお願いいたします。



| | 勉強会 | 18:39 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】8/5(金)MiSeq入門
8月5日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会の御案内です。

今回の勉強会は、「MiSeq入門」と題しまして、イルミナ株式会社様の御協力のもと、2部構成とさせていただきました。

第1部「MiSeqの技術的な解説」(担当:イルミナ株式会社様)
第2部「MiSeqデータを用いた多型解析」(担当:アメリエフ株式会社)


デスクトップNGSであるMiSeq(イルミナ社)より得られたデータから、
多型情報(SNPやIndelなど)を抽出し、データ解析を行います。
多型情報を得るまでに必要なファイル操作、及びフリーの解析ツールを用いた操作を実際のコマンドも交えて御紹介させていただきます。

              記
日時:2011年8月5日(金) 16:00〜17:30(第1部:45分、第2部:45分)
場所:東京ライフサイエンスインキュベーションオフィス 会議室A
   (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員:24名
会費:無料
※)前回と同様、申し込み締切前に満席となることが予想されますので、
  お早めのお申し込みをお願いいたします。

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。

また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。
予算は4,000円です。

どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、8/1(月)までにお問い合わせからお早めにご連絡ください。
その際は、下記のように表記していただきますと幸いでございます。
勉強会(16:00〜17:30)  ○
懇親会(18時〜)     ○

皆様とお会いできることを楽しみにしています。
| | 勉強会 | 17:12 | comments(0) | trackbacks(0) |
7/22(金)のバイオインフォマティクス勉強会を再度案内させていただきます!!
弊社初のバイオインフォマティクス勉強会@京都がいよいよ今週金曜日(7/22)に開催いたします。まだ空席もございますので、興味のある方は、ぜひご参加ください!!

テーマ:次世代シーケンサー(NGS)による多型解析入門
日時:2011年7月22日(金) 16:00〜17:30
※受付開始時間は15:50
場所:キャンパスプラザ京都 5階 第4演習室
地図:http://www.consortium.or.jp/contents_detail.php?frmId=585
定員:26名
テキスト代:お一人 1,000円(当日受付にてお支払いください)

お申し込みはコチラからお願いいたします。
| | 勉強会 | 17:43 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】7/22(金)NGSによる多型解析入門@京都
7月22日(金)に「京都で」開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
なお、こちらは6/25(土)の勉強会とほぼ同一の内容となりますので、
関西方面でご興味のある方々にご転送いただけましたら幸いです。

テーマは、「次世代シーケンサー(NGS)による多型解析入門」です。

ExomeやWhole-genomeなどのResequencingをNGSで行ったデータから、
多型情報(SNPやIndelなど)を抽出し、データ解析を行います。
フリーの解析ツールや実際のコマンドもご紹介させていただきます。

              記
日時: 2011年7月22日(金) 16:00〜17:30
場所:キャンパスプラザ京都 5階 第4演習室
地図:http://csvr15.consortium.or.jp/campusplaza/access.html
定員:26名
テキスト代:お一人 1,000円(当日受付にてお支払いください)

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。


また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。
予算は4,000円です。

どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
7/20(水)までにお申し込みをお願いいたします。

勉強会(16:00〜17:30)   ○
懇親会(18時〜)     ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。

アメリエフ株式会社
代表取締役社長 山口 昌雄
| 社長 | 勉強会 | 09:34 | comments(0) | trackbacks(0) |
【締切】6/25(土)NGSによる多型解析入門
6月25日(土)の第6回バイオインフォマティクス勉強会「NGSによる多型解析入門」に、多くの皆さまからお申し込みをいただきありがとうございました。

予想を上回るお申し込みをいただき、急遽定員を3名増やして対応いたしましたが、定員27名いっぱいとなりましたので、募集を締め切らせていただきます。
多数のお申し込みをいただき、誠にありがとうございました。

7月から8月の間に、京都および東京での勉強会開催を予定しております。
ご活用いただけましたら幸いです。

| きむ | 勉強会 | 17:41 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】6/25(土)NGSによる多型解析入門
6月25日(土)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

今回のテーマは、「次世代シーケンサー(NGS)による多型解析入門」です。

実験をメインに研究をされている方が、バイオインフォマティクスに取り組もうと考えている、もしくは取り組み始めている、という方を主に対象としています。

ExomeやWhole-genomeなどのResequencingをNGSで行ったデータから、
多型情報(SNPやIndelなど)を抽出し、データ解析を行います。
VCFファイルの説明や、フリーの解析ツールや実際のコマンドもご紹介させていただきます。

              記
日時: 2011年6月25日(土) 15:30〜17:00
場所:東京ライフサイエンスインキュベーションオフィス 会議室A
   (東京都立産業貿易センター 浜松町館6階)
地図:http://tlic.incubation-center.com/access.htm
定員:24名

※)前回と同様、締切前に満席となることが予想されますので、
  お早めにお申し込みをお願いいたします。

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。
WiMAXは感度良好のお部屋です。


また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ懇親会への参加をご検討ください。予算は4,000円です。

勉強会のみの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
6/20(月)までに、こちらのお問い合わせページからお申し込みをお願いいたします。

勉強会(15:30〜17:00)   ○
懇親会(17時半〜)     ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。

アメリエフ株式会社
代表取締役社長 山口 昌雄
| 社長 | 勉強会 | 14:18 | comments(0) | trackbacks(0) |
【バイオインフォマティクス勉強会】ご参加いただきありがとうございました
雨にもかかわらず、4/23(土)の【バイオインフォマティクス勉強会】「次世代シーケンサーのデータ解析入門」にお越しくださりありがとうございました。

質問も多数頂戴し、活発な議論ができたと考えております。
重ねまして、お礼申し上げます。ありがとうございました。

勉強会後の懇親会も大いに盛り上がり、半分以上のメンバーが二次会にも参加してくださいました。他では聞けない情報など、懇親会ならではの魅力があるとおもいます。


6月にもバイオインフォマティクス勉強会を開く予定ですので、ご期待ください!
| 社長 | 勉強会 | 11:13 | comments(0) | trackbacks(0) |
【締切】次世代シーケンサーのデータ解析入門
4月23日(土)の第5回バイオインフォマティクス勉強会「次世代シーケンサーのデータ解析入門」ですが、定員いっぱいとなりましたので、募集を締め切らせていただきます。

お申し込みいただきました皆さま、ありがとうございました。
| きむ | 勉強会 | 11:37 | comments(0) | trackbacks(0) |
【勉強会のお知らせ】次世代シーケンサーのデータ解析入門
4/23(土)に開かれる第5回バイオインフォマティクス勉強会に、多くの皆さまからお申し込みをいただきありがとうございました。

内容は、次世代シーケンサーのデータ解析入門です。
お手数ですが、詳細は社長ブログをご覧ください。
お申し込みは弊社ホームページ「お問い合わせページ」からお願いいたします。

予想を上回るお申し込みをいただきましたので、急遽定員を増やして対応しておりますが、あと数名で定員になります。
定員になり次第、締め切りとさせていただきますので、ご了承くださいますようお願い致します。

東京以外での勉強会開催も検討しております!
弊社ホームページ「お問い合わせページ」からリクエストいただけますと幸いです。
| きむ | 勉強会 | 18:18 | comments(0) | trackbacks(0) |
【勉強会のお知らせ】12/4(土)バイオ研究のためのLinux入門
アメリエフ株式会社の山口です。

12月4日(土)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

今回のテーマは、「バイオ研究者のためのLinux入門」です。
Linuxのインストールから、BLAST、Primer3などのフリーソフトのセットアップとデータベースの配置や簡単な実行方法までご紹介します。

取り上げて欲しいオープンソースソフトがありましたらご一報ください。検討させていただきます。
また、ラボの同僚やお友達とのご参加も歓迎です。


              記
日時: 2010年12月4日(土) 15時〜17時
場所:文京区シビックセンター5階 区民会議室D
地図:http://www.city.bunkyo.lg.jp/sosiki_busyo_shisetsukanri_shisetsu_civic.html
定員:20名
予算:お一人500円

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
WindowsにインストールしたVMware PlayerにLinuxをインストールます。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。


また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
予算は5000円です。
いろいろな研究分野の方と情報交換できるチャンスですので、ぜひご検討ください。


どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
11/29(月)までにお問い合わせフォームからご連絡をお願いいたします。

勉強会(15時〜17時)   ○
懇親会(17時半〜)    ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。
| 社長 | 勉強会 | 18:51 | comments(0) | trackbacks(0) |
【勉強会のお知らせ】ゲノムマップViewerの使い方
アメリエフ株式会社の山口です。

10月2日(土)に開かれる第三回バイオインフォマティクス勉強会のお知らせです。

今回のテーマは、「ゲノムマップのviewer」です。
「UCSC GenomeBrowser」と「IGV(Integrative Genomics Viewer)」を利用し、
次世代シーケンサーによる解析結果をゲノムマップ上で閲覧する方法や、
CNV解析、メチル化解析などの結果をゲノムマップ上で表示する方法をご紹介いたします。

・UCSC GenomeBrowser
http://genome.ucsc.edu/

・IGV(Integrative Genomics Viewer)
http://www.broadinstitute.org/igv/


              記
日時: 2010年10月2日(土) 15時〜17時
場所:文京区シビックセンター5階 区民会議室D
地図:文京シビックセンター・案内図
定員:20名
予算:お一人500円

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
基本的にはWindows上での操作になります。
ノートPCの持ち込みは可能ですが、ネット環境の準備はございません。


また例によって、勉強会後に懇親会を開きたいとおもいます。
予算は4000円〜5000円です。


勉強会のみの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
9/27(月)までにこちらのお問い合わせフォームまでご連絡をお願いいたします。

勉強会(15時〜17時)   ○
懇親会(17時半〜)    ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。


ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡いただけましたら幸いです。

よろしくお願い申し上げます。
| 社長 | 勉強会 | 17:53 | comments(0) | trackbacks(0) |
SNP解析の勉強会が無事に終了しました
アメリエフ株式会社の山口です。
先週土曜日に開かれました「第二回バイオインフォマティクス勉強会『SNP解析の実践』」は、懇親会まで含めまして無事に終了いたしました。

ご参加くださいました皆様、参加をご検討くださいました皆様、ありがとうございました。

予想以上のご応募を頂き、締切前に定員いっぱいになりましたので、プレッシャーも少なからず感じておりましたが、少しでも実りのある勉強会になっていましたら幸いです。


近くの居酒屋で開かれた懇親会は16名のご参加をいただき、同じような研究上の課題を抱えた仲間同士ですので、大変盛り上がった会になりました。

その場での情報交換や交流を通して、今後の研究の一助となりましたら、これ以上の喜びはありません。

皆様、本当にありがとうございました。
| 社長 | 勉強会 | 10:11 | comments(1) | trackbacks(0) |
【締切】SNP解析の勉強会
8月21日(土)の第2回バイオインフォマティクス勉強会「SNP解析の実践」ですが、予定より早く定員いっぱいとなりましたので、募集を締め切らせていただきます。

ご好評いただき、ありがとうございました。
身が引き締まる思いです!


今回はご都合がつかず参加できなかったかたや、遠方のため参加できなかった方もいらっしゃるようです。

問い合わせページからご相談いただけましたら、他の地域・日程での開催や、何かしらのフォローができるかもしれませんので、遠慮無くご相談いただけたらとおもいます。

重ねまして、ありがとうございました。
| 社長 | 勉強会 | 21:46 | comments(0) | trackbacks(0) |
【定員間近】SNP解析の勉強会
お久しぶりです!
キムです。

7月末からご案内しておりました
8月21日のバイオインフォマティクス勉強会【SNP解析の実務】が、
いよいよ来週に迫りました。

多くの皆様からお申し込みをいただき、誠にありがとうございました。
あと2名で定員になりますので、定員になり次第、締め切りとさせていただきます。
ご了承くださいますようお願い致します。

お申し込みいただいた皆様と、当日会場でお会いできるのを楽しみにしております。

| きむ | 勉強会 | 19:08 | comments(0) | trackbacks(0) |
【勉強会のお知らせ】SNP解析の実務
アメリエフ株式会社の山口です。
梅雨が明けて暑い日が続きますが、みなさんいかがお過ごしでしょうか。

8月21日(土)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご連絡です。

今回のテーマは、ブログでの反響が大きかった「SNP解析の実務」です。
私が講師を務めさせていただきます。
GWAS(ゲノムワイド関連解析)、
CNV(Copy Number Variation)、
ハプロタイプ(Haplotype)、
QTL(Quantitative Trait Locus、およびExpressionQTL)

の解析を扱います。

使用ツールは以下の3つです。

PLINK:GWAS解析パッケージ
HaploView:ハプロタイプ解析ツール
PennCNV:CNV解析ツール

必要に応じて、統計解析パッケージ「R」も加えます。

              記
日時: 2010年8月21日(土) 15時〜17時
場所:文京区シビックセンター5階 区民会議室B
地図:文京シビックセンター・案内図
定員:20名
予算:お一人500円

プロジェクターで投影しながら進行していきます。
基本的にはLinux上での操作になります。
VMwareで、ノートPC上にLinux環境を構築してのご説明になります。


また、勉強会後に懇親会も開きたいとおもいます。
こちらのブログの読者様は懇親会のみの参加も大歓迎です!
予算は4000円〜5000円です。


どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、
できるだけ8/13(金)までに、こちらのフォームへご連絡をお願いいたします。

勉強会(15時〜17時)   ○
飲み会(17時半〜)    ○


ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くコメントいただけましたら幸いです。
| 社長 | 勉強会 | 10:21 | comments(0) | trackbacks(0) |
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